生物信息资源
生物信息资源
本系发布了丰富的生物信息学平台,部分生物信息资源如下:
HMDD:人类miRNA疾病数据库 https://www.cuilab.cn/hmdd (崔庆华、周源)
LncRNADisease:LncRNA疾病数据库 http://www.rnanut.net/lncrnadisease/ (崔庆华)
PhaSepDB:液-液相分离相关蛋白数据库 http://db.phasep.pro/ (李婷婷)
TAM:miRNA集合富集分析工具 http://www.cuilab.cn/tam/ (崔庆华)
MISIM:miRNA功能相似度计算、网络构建、疾病预测在线服务器 http://www.lirmed.com/misim/(崔庆华,周源)
LncTar:lncRNA-RNA互作预测在线服务器 http://www.cuilab.cn/lnctar (崔庆华)
ASEB:KAT特异乙酰化位点预测在线服务器 http://cmbi.bjmu.edu.cn/huac (李婷婷)
PTM-X:蛋白间翻译后修饰互作预测在线服务器 http://bioinfo.bjmu.edu.cn/ptm-x/ (李婷婷)
CEFCIG: 基于表观遗传特征的细胞身份基因挖掘软件https://github.com/bxia888/CEFCIG(夏勃,赵东宇,王光煜,陈开富)
PGAP-X:原核生物泛基因组分析可视化软件 http://pgapx.ybzhao.com (赵永兵,孙晨,赵东宇,吴佳妍,肖景发)
Wikicell:人类转录组一代测序交互式数据库 http://wikicell.big.ac.cn(赵东宇,吴佳妍,肖景发,于军)
PMirP:microRNA前体在线预测工具 http://ccst.jlu.edu.cn/ci/bioinformatics/MiRNA (赵东宇,王岩,梁艳春)
GE-Impute:单细胞转录组数据填补软件工具 https://github.com/wxbCaterpillar/GE-Impute(周源)
IntiCom-DB:跨组织通讯分子数据库 http://rnanut.net/inticomdb/ (周源)
LE-MDCAP: 疾病因果性致病miRNA预测在线工具 http://www.rnanut.net/LEMDCAP/ (周源)
m6Adecom: m6A甲基化集合分析在线工具 http://www.rnanut.net/m6adecom/ (周源)
SRAMP: RNA m6A甲基化修饰位点预测在线工具 https://www.cuilab.cn/sramp(崔庆华、周源)
PACES: ac4C乙酰化预测在线工具 http://www.rnanut.net/paces/(周源、崔庆华)
SpatialcoGCN: 空间转录组反卷积软件工具 https://github.com/wwYinYin/SpatialcoGCN(周源)
TransmiR: 转录因子-microRNA调控数据库 https://www.cuilab.cn/transmir(崔庆华、王娟、周源)
tRFTar:tRF靶基因预测工具 http://www.rnanut.net/tRFTar/(周源、崔庆华)