医学生物信息学系

北京大学基础医学院医学生物信息学系，前身医学信息学系成立于2004年7月12日，是北京大学根据当前国家和医学行业的需要，批准成立的一个新系。她的定位是“以校重点学科为依托，以医学信息学的研究为核心，面向医教研，以科研带动服务，为医教研提供医学信息学服务”。医学生物信息学系主要研究和教学领域包括生物信息学和系统生物学，是生物医学和信息学交叉的新兴科学。

本系经过近几年的发展，取得了较大的进步，近几年共发表科研论文50余篇。近年，本系获得国家自然科学基金12项，其中NSFC杰青2人、优青1人、海外优青1人，其他国家级基金3项，另有其他横向合作基金项目多项。本系共开发各类拥有自主知识产权的生物信息学平台50余个，用户遍及全球六大洲120余个国家或地区，在国际上具有一定的影响力。

现任系副主任（主持学系工作）赵东宇研究员，党委书记李婷婷研究员。

一、概况介绍

医学生物信息学系现有正高4名（崔庆华教授，博士生导师；李婷婷研究员，博士生导师；周源研究员，博士生导师；赵东宇研究员，博士生导师）；副高1名（王娟副教授，博士生导师），教辅人员1名（姚鹏英主管技师）；约30名博士研究生和3名硕士研究生。此外，现有3位其他系所博士生导师在医学生物信息学招生（杨恩策研究员、吴华君研究员、薛瑞栋研究员），现开设研究生课程6门，并承担基础医学本科必修课“医学中的理工信”编程教学工作。

二、历史延革

2000年前后，随着人类基因组计划的实施和各种组学技术的突飞猛进，心血管所汤健教授敏锐地意识到20世纪科学的最大成就是信息科学和生命科学的发展，两者的结合将是21世纪科学发展的必然趋势。

汤健教授于1999年成立了中国医学生物信息网（CMBI），它是我国最早建立的专业医学生物学服务的网站之一。

2000年汤健教授组建了医学生物信息学研究组，归属在心血管所里进行工作。

基于全国还没有一个专门培养医学信息科学人才的基地和部门的考虑，汤健教授便向学校建议组建医学生物信息系，着重培养医学生物信息学的专业人才，同时开展医学信息学的研究，并为医学的教育、研究、医疗、开发提供信息服务。这项建议得到了学校的大力支持，于2004年7月正式批准成立了医学信息学系。

三、大事记

1999年，汤健教授成立了中国医学生物信息网（CMBI），它是我国最早建立的免费专业医学生物学服务的网站之一。

2000年，汤健教授组建了医学生物信息学研究组，归属在心血管所里进行工作。

2002年，医学生物信息学研究组在汤健教授带领下，选择了研究所的优势研究项目——心血管分子生物学、生物活性多肽和肾上腺素能受体，结合国家973项目任务，作为研究生的课题，开始了心血管数据库的研究与实践。

2003年4月10日，中国医学生物信息网在全国率先开通了“SARS”专题网站，宣传党的政策、介绍防治知识、搜集研究成果、传播研究动态，及时、科学和主动地为全国提供SARS的研究和防治信息服务。为第一线工作人员全文提供全世界的研究报告，成为全国最受欢迎的SARS专题网站之一。在4—5月份，网站的点击率每天高达5000—10000人次。

2004年，医学生物信息学研究组完成了心血管疾病核酸和蛋白质、生物活性多肽和肾上腺素能受体三个主体数据库。从此，我们有了我们中国人自己建立的心血管专业数据库。不仅填补我国数据库的空白， 同时在国际上也率先开创了心血管专业数据库。在国际知名的Internal、J、Cardiology和Regulatory peptides的杂志上发表。

2004年7月，学校正式批准成立了医学信息学系，尚彤担任系主任。

2009年，尚彤退休，崔庆华担任第二任系主任。

2018年10月，学校正式批准成立医学生物信息学二级学科。

2018年12月，“医学信息学系”更名为“医学生物信息学系”。

2022年，医学生物信息学系搬至医学科技楼3层、12层。

2023年，医学生物信息学系党支部成立，李婷婷担任第一任党支部书记。

2023年，赵东宇任学系副主任（主持学系工作）。

四、代表人物

汤健教授，全国著名的心血管研究专家，北京大学心血管研究所所长、名誉所长、卫生部心肺内分泌和调节肽重点研究室主任。原国家重大基础发展计划心血管病和肿瘤研究项目首席科学家，北京市政府科学顾问。长期从事心血管基础研究，曾主持和参加了国家65、75、85、95心血管攻关计划，国家生物高技术发展计划（863），国家重大基础发展计划（攀登计划和973计划）心血管相关项目，是我国心血管活性多肽、分子生物学和医学生物信息学研究的主要开拓者和奠基人之一。曾在 Nature cell biology、PNAS、中国科学和中华医学杂志等国内外著名期刊上发表600多篇学术论文，著有心钠素、心血管活性物质、原癌基因、心血管分子生物学等十多本专著，曾两次获得国家科技进步奖，四次获得卫生部、北京市一级科技成果。1991年被国家人事部授予有国家突出贡献科学家称号。

五、研究与服务

目前，我系医学生物信息学二级学科形成了3个研究方向：疾病组学数据的生物信息学分析、疾病基因的生物信息学识别和疾病防治药物的生物信息学研发。在这些方向，我系开发了一系列的具有完全自主知识产权的生物信息学平台。同时，为北京大学兄弟院系、附属医院，以及其他科研单位提供了高通量数据分析以及预测等服务。